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一方面是用热力达到温通经络，行气活血，驱寒除湿等效果。
艾灸是依靠点燃艾绒产生的热量进行的，另一方面是借助艾草本身的药力，因为艾草是中药中少有的能够通十二（条）经的药物，所以古人经过千年的摸索，最终将艾草定为施灸的主要原料。由于艾草的药效，点燃有热能，艾灸穴位对穴位刺激是药效加热能物理刺激产生经络效应。现代研究还发现艾灸燃烧时产生的热能，是一种十分有效并适应于机体治疗的物理因子红外线,且近红外线占主要成分。近红外线可激励人体穴位内生物因子的氢键，产生受激相干谐振吸收效应，通过神经体液系统传递人体细胞所需的能量。艾灸时的红外辐射可为机体细胞的代谢活动，免疫功能（的提高）提供所必需的能（量），也能给缺氧也能给缺乏能量的病态细胞提供活化能。而艾灸施于穴位，其近红外辐射具有较高的穿透能力，可通过经络系统，更好的将能量送至病灶而起作用。
艾灸能除湿祛寒，舒筋活血，疏通经络，对于一些疾病，可以起到一定的辅助调理作用，效果十分显著。