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脂肪肝患者通常伴有代谢紊乱综合征或肝脏损伤的情况，因此，用药治疗应当结合患者个人病情遵医嘱进行选择。
对于伴有血脂异常、糖尿病、肥胖等代谢紊乱情况的脂肪肝患者，建议通过正规减肥药物、降糖药物和调脂、降压药物进行治疗。常见为奥利司他、二甲双胍、瑞舒伐他汀、贝那普利等，这类药物可通过降低患者体内血脂、低密度脂蛋白胆固醇等重要指标水平，达到改善代谢紊乱，减轻体重、调节血脂的效果。
此外，由于脂肪肝早期症状并不明显，患者可能会忽视疾病检测治疗，加剧病情进展。如果患者肝功能已经受损，可出现腹胀、腹痛等情况。此时患者可以在医生指导下服用门冬氨酸鸟氨酸、多烯磷脂酰胆碱、葵花护肝片等药物治疗。如葵花护肝片，该药是由五味子、柴胡等多味药材配制，具有保肝降酶的功效，用药后有助于降低转氨酶水平，修护肝细胞膜，改善肝功能，预防肝纤维化的发生。
药物治疗外，患者也应重视日常调理，保持清淡饮食及适当锻炼频率，可降低体内脂肪水平，辅助改善脂肪肝。