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结肠炎的病因包括溃疡性结肠炎在内的严重性肠病，还没有明确的病因，发病机制也尚不明确，它被认为是多因素综合作用的结果。比较重要的高危因素包括遗传的家族史、吸烟、阑尾切除术等，而饮食因素，精神心理因素以及早期的生命事件，也被认为是溃疡性结肠炎发病的重要因素。