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早晨起床以后嘴巴干苦应该考虑口腔疾病、消化系统或者内分泌的原因。具体病因应该在医院检查以后进行判断，对症下药。
如果口腔内有炎症，如牙龈炎、牙周炎等，会因为残留很多牙垢和脏东西，大量的细菌繁殖，这种细菌代谢产物就会产生腐败难闻的气味。一些肝胆疾病如胆囊炎、胆结石的病人，胆汁反流至胃，也会引起口苦。当人体的消化系统出现疾病的时候，比如消化性的溃疡、肠炎、胃炎等，从中医的角度来讲，这些疾病会导致人体肠胃内的浊气上升，从而出现口苦的症状。一些生活习惯差的人，比如长期酗酒、抽烟，缺乏健身和运动的人，加上长期饮食搭配不良，进食的食物在肠胃停滞时间过长，也容易感到口苦异味。缺乏维生素B12或者锌可能会造成嘴里发苦，一些药品的副作用也会有口干苦症状。要预防口干苦，应当注重口腔的卫生，作息规律，饮食合理，或是适当地补充维生素和营养元素。
另外要注意长期口苦也可能是口癌、胃癌还有乳腺癌等癌症的前兆，建议出现口干苦时先进行必要的检查，排除器质性的问题，尽早就医诊断。