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临床应用比较广泛的小儿腹泻药物包括止泻药、调节菌群药以及抗感染药，家长要根据宝宝情况合理选用药物，帮助宝宝早日脱离疾病困扰。
宝宝由于年龄较小，各个系统功能发育尚不完善，容易受到外界因素的影响，引起拉肚子的症状，为避免持续性的腹泻影响宝宝健康，家长要及时采取措施控制拉肚子频次，可以给宝宝外用丁桂儿脐贴，该药物由丁香、肉桂、荜茇等中药组成，具有健脾温中，散寒止泻的功效，能够较好的改善因寒凉、伤食引起的拉肚子，采用中医传统脐疗法，通过脐部给药，药物经脐部渗透直达腹部，作用直接，外用药可减少宝宝口服药物的抗拒心理，降低喂药烦恼。
若宝宝的肠道菌群失调，也可因菌群紊乱引起拉肚子。对于这类情况，家长可以给宝宝服用一些调节菌群的药物，例如枯草杆菌二联活菌等，通过平衡宝宝的肠道菌群，改善宝宝微生态平衡，从而减轻腹泻症状。
另外，病毒或细菌会引起宝宝出现感染性的腹泻，宝宝还会伴随发热、恶心、呕吐等症状，对于这类原因导致的腹泻，需及时就医明确是病毒还是细菌感染，再针对性用药治疗。